اعتمد وزير الصحة المفوض بحكومة الوفاق الوطني "أحميد بن عمر" مؤخرا الهيكل التنظيمي الداخلي للمستشفيات القروية بموجب القرار رقم 134 لسنة 2019.
وحددت المادة رقم (2) من نص القرار المهام التي تتولاها المستشفيات القروية ، والمتمثلة في تقديم الخدمات الطبية الوقائية والتشخيصية والعلاجية في مختلف التخصصات الطبية.
كما تتولى المستشفيات أيضًا توفير أعلى مستوى ممكن من الرعاية الطبية للمرضى (الوقائية والتشخيصية والعلاجية) بمختلف مراحلها ووضع برامج تحقيق الجودة النوعية للخدمات إلى جانب متابعة البحوث والدراسات والاختراعات في المجالات الطبية، وتوفير المعلومات والبيانات والإحصائيات عن نشاط المستشفى وتحديد الموارد المتاحة له.
كما تختص المستشفيات القروية وفقًا لنص القرار بعقد الاتفاقيات الثنائية مع المستشفيات المناظرة لها بهدف تبادل الخبرات وتطوير الخدمات الطبية إلى جانب رفع كفاءة العاملين بالمستشفى من خلال الدورات التدريبية أثناء العمل للرفع من مستوى آدائها، فضلاً عن إعداد الدورات التخصصية للعناصر الطبية والطبية المساعدة بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة. وحددت المادة رقم (3) من القرار ، التقسيمات التنظيمية التي يتكون منها الهيكل التنظيمي، فيما حددت المواد من (4) إلى (13) اختصاصات التقسيمات التنظيمية التي حددها الهيكل التنظيمي في المادة رقم (3).
وبموجب المادة رقم (14) تلغى القرارات رقم (179) لسنة 2009 ورقم (244) لسنة 2014 ورقم (545) لسنة 2018 . كما يجوز استحداث أقسام علاجية وتشخيصية بقرار من وزير الصحة بناءً على عرض من مدير عام المستشفى وذلك وفقًا للمادة رقم (15) من نص القرار.